Palírna Bunnahabhain byla založena v r. 1881, v r. 1887 došlo ke sloučení se společností W. Grant & Co (Glenrothes) za vzniku Highland Distilleries Co Ltd. V r. 1963 byl při přestavbě zvýšen počet kotlů z 2 na 4. V r. 1999 se společnost Highland Distillers stala součástí Edrington Group, která r. 2003 prodala Bunnahabhain společnosti Burn Stewart Distillers. Bunnahabhain vyrábí nejméně rašelinnou whisky ze všech palíren na Islay. Stáčí se zde 12-letá single malt a příležitostná ročníková plnění. Whisky je též součástí míchaných Famous Grouse a Black Bottle.